Apesar de atravessada por diversos cursos de água, a freguesia dos Altares é pobre em recursos hídricos já que as ribeiras existentes são hoje de carácter torrencial,
correndo de forma efémera apenas após chuvadas intensas.
Essa não era a situação nos tempos da colonização, já que a floresta e as turfeiras então existentes tinham um efeito regularizador mantendo pequenos caudais nas principais
ribeiras durante quase todo o ano.
São as seguintes as ribeiras que atravessam a povoação (de leste para oeste):
- Ribeira do Pamplona, que delimita a freguesia (e simultaneamente o concelho de Angra do Heroísmo) dos Arrochela;
- Ribeira de Lapa, uma das mais caudalosas da freguesia;
- Ribeira da Luz;
- Ribeira de São Roque, junto da qual se ergue a igreja paroquial e se concentra a zona central da freguesia, designada por Lugar. Esta ribeira tem como afluente na sua margem esquerda a Ribeira das Lajinhas;
- Ribeira dos Gatos.
